De wolkbreuk die zich begin augustus 2002 boven de stad Groningen heeft voorgedaan heeft voor grote waterschade gezorgd in het toenmalige pand van OVMG aan het Lopende Diep. Ongeveer de helft van de archiefdozen met documenten waren in meer of mindere mate aangetast door het regenwater. Dit heeft tot gevolg gehad dat de hele documentencollectie vakkundig moest worden gedroogd en behandeld met gammastralen waarna nog een omvangrijke nabehandeling moest plaatsvinden in de vorm van omdozen, ontnieten en verwijdering van schimmelresten. Verder moest de bibliotheekruimte volledig leeggehaald en ontsmet worden, opnieuw van een verfje worden voorzien en er kwamen nieuwe vloerbedekking en stellingen.
Een bericht in het Dagblad van het Noorden heeft tot gevolg gehad dat een groot gedeelte van de landelijke pers aandacht aan deze 'natuurramp' bij OVMG heeft besteed. Overigens werden in deze zomer ook de archieven van Wijk bij Duurstede en Praag geplaagd door ernstige wateroverlast.
Deze ramp had voor OVMG toch een positieve wending: zij was aanleiding voor OVMG om te zien naar een andere locatie. Deze werd gevonden bij de Groninger Archieven. Op 24 februari 2004 vond de definitieve verhuizing plaats.